Sjöhistoriska är en del av Statens museer för maritim, transport- och försvarshistoria.
Statens museer för maritim, transport- och försvarshistoria (SMMTF) är en statlig myndighet som har till uppgift att bevara och utveckla kulturarvet samt att främja och bygga upp kunskaperna inom sina områden. Verksamheten ska vara en angelägenhet för alla människor i samhället.
SMMTF driver och utvecklar sju museer på fyra orter – Armémuseum i Stockholm, Flygvapenmuseum i Linköping, Järnvägsmuseet i Gävle, Marinmuseum i Karlskrona samt, Sjöhistoriska museet, Vasamuseet och Vrak – Museum of Wrecks i Stockholm. Dessutom ingår civilflygsamlingarna samt de väg- och trafikhistoriska samlingarna i Kjula i SMMTF.
I myndigheten ingår även Försvarets traditionsnämnd, en expertgrupp för rådgivning om försvarets traditioner.